ตัวละครสำหรับ "มิโสะ" ปรากฏตัวครั้งแรกในวรรณคดีสมัยเฮอัน
มิโสะ ไม่ได้ใช้เป็นเครื่องปรุงรสอาหารเหมือนในปัจจุบัน มันแพร่กระจายบนอาหารหรือเลียและกินโดยตรง นอกจากนี้ยังใช้เพื่อจ่ายเงินเดือนของชนชั้นสูงและเป็นของขวัญ มันเป็นสินค้าที่มีค่ามากจนเข้าไม่ถึงปากต่อปากของคนทั่วไป

พระในพุทธศาสนาที่มาจากประเทศจีนจากประเทศจีนในสมัยคามาคุระได้นำครกซูริบาจิมาด้วย ด้วยครกเหล่านี้เมล็ดข้าวอาจบดได้ง่ายและละลายในน้ำได้ง่าย นี่คือวิธีที่ มิโสะ เริ่มใช้ในซุป มิโสะ การเกิดขึ้นของ มิโสะ นั้นมีรูปแบบของเมนูอาหารพื้นฐานซึ่งมักเรียกว่า "อิจิจูอิจิซาอิ" (ซุปหนึ่งเมนูกับข้าวหนึ่งอย่างประกอบด้วยวัตถุดิบหลักซุปอาหารจานหลักและผักดอง) ของนักรบซามูไรในสมัยคามาคุระ เมนูนี้เดิมเน้นที่ความเรียบง่ายและประหยัด แต่ในยุคปัจจุบันได้รับความนิยมในฐานะอาหารที่สมดุล

การผลิตถั่วเหลืองเพิ่มขึ้นในช่วงยุคมูโรมาจิและเกษตรกรเริ่มทำ มิโสะ แม้แต่คนทั่วไปก็เริ่มใช้ มิโสะ เป็นอาหารถนอมอาหาร มิโสะ เห็นในปัจจุบันถูกสร้างขึ้นในช่วงเวลานี้

นักรบซามูไรเซ็นโกคุมักจะนำ มิโสะ ด้วยเสมอเมื่อพวกเขามุ่งหน้าเข้าสู่สนามรบ ในสมัยนั้น มิโสะ ถูกใช้เป็นเครื่องปรุงรสและเป็นแหล่งโปรตีนที่มีคุณค่า สามารถเก็บรักษาและพกพาได้ง่ายในสภาพแห้งหรือย่าง ชินเก็น ทาเคดะ ส่งเสริมการผลิต "Shinshu มิโสะ", Hideyoshi Toyotomi และ Ieyasu Tokugawa ได้เลื่อนตำแหน่ง "มิโสะถั่วเหลือง" และ Masamune Date ได้เลื่อนตำแหน่งเป็น "Sendai มิโสะ"

เมื่อจำนวนประชากรในเอโดะถึง 500,000 คนการผลิต มิโสะ ไม่สามารถผลิตได้ทันต่อความต้องการ มิโสะ จากชนบทเช่นมิคาวะและเซนไดถูกส่งไปยังเอโดะและ มิโสะ ก็เจริญรุ่งเรือง เนื่องจากมีผู้ชายมากกว่าผู้หญิงที่อาศัยอยู่ในเอโดะร้านอาหารหลายแห่งจึงเปิดขึ้นโดยมี มิโสะ ในเวลาเดียวกัน ไพร่เริ่มกิน มิโสะ ซุปและ มิโสะ วางกลายเป็นอาหารที่คุ้นเคย

เมื่อเวลาผ่านไป มิโสะ พัฒนาจากถังขนาดใหญ่ไปสู่ถ้วยที่สามารถเก็บไว้ในตู้เย็นได้อย่างง่ายดาย
มิโสะ มี น้ำสต็อกดาชิ ซึ่งขจัดความจำเป็นในการเตรียม น้ำสต็อกดาชิ ถูกนำมาใช้ในช่วงโชวะและเป็นตัวช่วยที่ดีในการช่วยเหลือผู้หญิงที่ก้าวไปข้างหน้าในสังคม